문제는 없을거같습니다.
저도 2구 기포기 Y자형으로 몰아서 사용중인데 큰 문제는 없습니다

2구 기포기로 여과기 3개를 돌리신다는 것은
조금 욕심인것 같습니다.
2구로 2개를 돌리고 비린내가 난다던지 할때
추가 기포기로 1개나 2개를 한번씩 돌리시는것이 좋아보입니다.
저는 현재 그렇게 사용하고 있습니다.

2구 기포기로 y자 사용가능 하지만 아무래도 2개 사용하는 것보다는 기포량도 줄고 좋지 않다고 생됩니다

질문에 2구 기포기 2개라고 적었는데 오해가 생겼군요
2구 기포기 용품이 2개가 있어서 총 4구의 에어를 합친다는 의미이고
2개의 용품이 에어압이 다르니 한쪽에 과부화로 문제가 생기냐는 질문입니다

기포기에 연결 시킬 여과기가 기압이 쎄지 않다면 큰 문제는 없어 보입니다.
터지지않는 풍선에 빨대 두개를 끼우고 두사람이 불면 기압이 쎄지면서
폐활량이 적은 사람 쪽으로 그 공기가 빠져나가겠지요.
그걸 기포기에 적용 시켜보시면 공기가 빠져나가는 구멍이 있기때문에 큰 문제는 없어 보입니다.